在实验中使用生物显微镜的正确步骤如下:
　　1.使用显微镜时，首先注意显微镜的通电规格(110v或220v)并插入正确的插座。
　　2.取出显微镜或取下储物盒的防尘盖。取出时，右手握住镜臂，左手握住镜座。取出后检查显微镜是否脏。如果很脏，用95%的酒精擦拭镜纸，去除物镜上的灰尘或污染物。
　　3.开启并调整合适的光源，避免光源过高、过强，使微生物标本死亡。
　　4.用塑料吸管取出待观察的微生物，放在载玻片上，然后用盖玻片以45度角覆盖，避免产生气泡。
　　5.将完成的标本放在显微镜台上，用载玻片夹固定两端；操作者左眼对准目镜观察，调整光源和光圈，使显微镜视野亮度均匀。通常，生物检测从低放大率物镜开始
　　6.转动粗调轮，使低倍率物镜下降，几乎接触到标本载玻片。对象图像出现后，转动微调轮进行反复微调，直到图像清晰。
　　7.显微镜检查时要看双眼，找到合适的目标，将目标调整到视野中间进行观察。
　　8.更换大功率观察物镜，用微调轮对准焦距，将光圈重新调整到合适的亮度，然后转动微调轮反复微调，直到物体图像清晰。
　　9.观察时双眼同时睁开，用左眼观察，用右眼画出结果。由于高倍物镜焦距较浅，在绘制结果时需要转动微调轮。描绘时不要有操作者的主观意识，观察到的实验结果都要画进去，不能选择性填写。